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Etiqueta: profesional

  • RNA-Seq: From FASTQ to Counts

    As a bioinformatician, the most common request I receive is to analyze sequencing data.  I prepared this seminar focused on the recommendations I would love to have when I’ve started on this path.

    Whether you’re working with private or public data, here’s the workflow I always recommend:

    ✅ Set up a clean project folder from day one

    ✅ Estimate your file sizes and check storage & compute capacity

    ✅ Retrieve your raw data (private or public sources)

    ✅ Run QC — non-negotiable

    ✅ Launch your NGS pipeline of choice

    💡 Pro tip: always run the full pipeline on a single sample first to benchmark time and resources.

    If you’re not sure where to begin, let’s talk. Book a free 30-minute call and we’ll design a plan tailored to your data and goals.

    🔗 https://instats.org/seminar/rna-seq-from-fastq-to-counts-1

    📩 DM me for a personal discount on the seminar

    contact@estepi.com

  •  𝐅𝐀𝐈𝐑 𝐝𝐚𝐭𝐚 𝐦𝐚𝐧𝐚𝐠𝐞𝐦𝐞𝐧𝐭 𝐚𝐧𝐝 𝐀𝐠𝐢𝐥𝐞 𝐩𝐫𝐚𝐜𝐭𝐢𝐜𝐞𝐬

    As a bioinformatician, I’ve seen firsthand how integrating Open Science principles 𝒆𝒔𝒑𝒆𝒄𝒊𝒂𝒍𝒍𝒚 𝑭𝑨𝑰𝑹 𝒅𝒂𝒕𝒂 𝒑𝒓𝒂𝒄𝒕𝒊𝒄𝒆𝒔 can significantly boost quality and productivity in research projects.

    It’s true that at the beginning there is a significant initial investment of time and effort. But when you reach 𝐩𝐮𝐛𝐥𝐢𝐜𝐚𝐭𝐢𝐨𝐧 𝐭𝐢𝐦𝐞 and resources, energy, and budget become limited—that early investment pays off… exactly the opposite of traditional approaches.

    If your team feels stuck and you want to implement FAIR principles with Agile methodologies in your bioinformatics workflows, I’d be happy to help. Let’s schedule a free 30-minute call to design a clear plan and innovate together.

    💡 Bonus: DM me for an exclusive 𝐝𝐢𝐬𝐜𝐨𝐮𝐧𝐭 on the seminar!

    ✉️ 𝐜𝐨𝐧𝐭𝐚𝐜𝐭@𝐞𝐬𝐭𝐞𝐩𝐢.𝐜𝐨𝐦

    🔗 https://instats.org/seminar/fair-data-practices-with-r-git-and-agile-1

  • Sociólogos al rescate

    Cómo se elaboran encuestas para evitar los sesgos en la colección de datos demográficos?

    📻 Nuevo episodio de Activismo de Datos en femiñetas Radio con Florencia Coll 

    En esta nueva edición de Activismo de datos, hablamos entre otras cosas del concepto de 

    la importancia de  desagregar en el análisis de datos sociológicos

    ¿Con esto suficiente o hay que plantear hipótesis diferentes?

    Lo prometido es deuda. Trajimos a nuestra primera invitada a la columna y aprendimos un montón. El privilegio es nuestro

    Nos quedamos con ganas de saber más y con la promesa de volver pronto cuando tenga nuevos los resultados de sus  líneas de trabajo actuales.

    ⚠️ Activismo de Datos es una columna mensual con eje en sensibilizar sobre el uso responsable de las nuevas tecnologías: 

     → Sesgos en la colección de datos (especialmente de género)

     → Sostenibilidad y costo energético

     → Confiabilidad de los modelos de IA

     → Soberanía de datos.. etc

    🕒 Escuchanos en vivo:

     📍 Martes de 15 a 16 h en El Prat Radio 91.6

     📍 Domingos de 19 a 20 h en Universidad Nacional de Rosario 103.3

  • Mujeres intrépidas que cambiaron el mundo 

    Cada segundo martes de octubre celebramos el Día de Ada Lovelace, una fecha dedicada a reconocer y honrar las contribuciones de las mujeres en las disciplinas STEM (ciencia, tecnología, ingeniería y matemáticas).

    Ada Lovelace, considerada la primera programadora del mundo, sigue inspirando a generaciones enteras. Su nombre resuena hoy en eventos sobre mujeres en tecnología y cada vez más en espacios más amplios, recordándonos la importancia de la diversidad en la innovación científica y tecnológica

    En este episodio trajimos el  libro ilustrado Mujeres de ciencia: 50 intrépidas mujeres que cambiaron el mundo de Rachel Ignotofsky. Un precioso y recomendado libro ilustrado para niñxs y adultxs que  pone de relieve las contribuciones de cincuenta mujeres notables a los campos de la ciencia, la tecnología, la ingeniería y las matemáticas, desde el mundo antiguo hasta nuestros días.

    🎙 Activismo de Datos es una columna mensual de radio femiñetas con Florencia Coll y Javiera Tapia Torra. El eje en sensibilizar y tomar acción frente a esta realidad datificada:

    → Sesgos en la colección de datos (especialmente de género)

    → Sostenibilidad y costo energético

    → Confiabilidad de los modelos de IA

    → Soberanía de datos… etc

    🕒 En vivo:

    📍 Martes de 15 a 16 h en El Prat Radio 91.6 (Barcelona, Esp)

    📍 Domingos de 19 a 20 h en Universidad Nacional de Rosario 103.3 (Rosario, Arg)


  • La Bioinformática es una interdisciplina

    Según Bill Gates, las profesiones mejor posicionadas frente a la IA serían aquellas relacionadas con la biología, la informática y las ciencias ambientales. Si nos basamos en esto, el futuro de los bioinformáticos parece optimista. Y yo estoy convencida que lo es.

    La bioinformática es una disciplina con múltiples aristas donde cada uno puede encontrar su lugar sin embargo hay que conocer cuáles son los roles para poner foco y especializarse. 

    Me llegan ofertas de bioinformática para todos los gustos, cada área tiene un título para su rol asociado y entiendo que esta información puede agobiarte cuando no estás en foco. 

    Si estás evaluando tu carrera en bioinformática y no sabes por dónde empezar o seguir, mi primer consejo es que empieces anotando cuáles son las cosas que te despiertan interés real, que te hacen entrar en flow, que te hacen olvidar por un rato de lo que está pasando afuera. 

    No es inmediato. Requiere una inversión de tiempo, silencio y autoescucha. 

    Y si ya estás ahí y te interesa hacer un plan para formarte y seguir en una dirección, escríbeme a ✉️ contact@estepi.com  y te acompaño en el despegue

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